บัณฑิตวิทยาลัย เป็นหน่วยงานที่รับผิดชอบและอำนวยการจัดกำาศึกษาในระดับบัณฑิตศึกษาเริ่มเปิดสอน ระดับบัณฑิตศึกษาเป็นครั้งแรก ในปี พ.ศ. 2546 ภาคเรียนที่ 1 ปีการศึกษา 2546 ได้เปิดสอนระดับปริญญาโทหลักสูตรครุศาสตรมหาบัณฑิต (ค.ม.) สาขำวิชาการบริหารการศึกษา ต่อมาในภาคเรียนที่ 3 ปีการศึกษา 2551 เปิดสอนหลักสูตรรัฐประศาสนศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาการปกครองท้องถิ่น (รป.ม.) จำกนั้นได้เริ่มเปิดหลักสูตรประกาศนียบัตรบัณฑิต วิชาชีพครู (ป.บัณฑิต วิชาชีพครู) ในภาคเรียนที่ 3 ปีการศึกษา 2549
ในการบริหารงานระดับบัณฑิตศึกษา ในช่วงเริ่มต้น ปีการศึกษา 2546 สภาสถาบันราชภัฏร้อยเอ็ด ได้ให้ความเห็นชอบการดำเนินงานตามปรากฏในข้อบังคับ ของสถาบันราชภัฏร้อยเอ็ด ว่าด้วยการจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา พ.ศ. 2546 จัดตั้งสำนักงานโครงการบัณฑิตศึกษา เพื่อรับผิดชอบการจัดการศึกษาตามโครงการ จากนั้นได้ปรับปรุงข้อบังคับสถาบันราชภัฏร้อยเอ็ด ว่าด้วยการจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา ฉบับเดิม เป็นข้อบังคับมหาวิทยาลัยราชภัฏร้อยเอ็ด ว่าด้วยการจัดการศึกษา ระดับบัณฑิตศึกษา พ.ศ. 2549 ให้สอดคล้องกับประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่องเกณฑ์มาตรฐานหลักสูตรระดับบัณฑิตศึกษา พ.ศ. 2548 จากการที่ได้ดำเนินภารกิจบัณฑิตศึกษาในรูปของสำนักงานบัณฑิตศึกษามาจนถึงปัจจุบัน ภาระงานได้ขยายตัวขึ้นเป็นจำนวนมาก ทั้งในด้านจำนวนนักศึกษา หลักสูตร งบประมาณ ปริมาณงานด้านวิชาการและมหาวิทยาลัยมีนโยบายต้องการจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา สนองตอบการพัฒนาท้องถิ่นให้เพิ่มขึ้นมหาวิทยาลัยราชภัฏร้อยเอ็ดจึงได้จัดตั้งหน่วยงาน “บัณฑิตวิทยำลัย” ให้เป็นส่วนราชการภายในมหาวิทยาลัยมีฐานะเทียบเท่าคณะในวันที่ 15 มีนาคม พ.ศ. 2551
บัณฑิตวิทยาลัยมีบทบาทในการจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาเริ่มมาตั้งแต่ภาคเรียนที่ 1 ปีการศึกษา 2546 จนถึง ปีการศึกษา 2558 โดยมีหลักสูตรที่สังกัดบัณฑิตวิทยาลัย ดังนี้
1) หลักสูตรครุศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาการบริหารการศึกษา
2) หลักสูตรศิลปศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาการสอนภาษาอังกฤษ
3) หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาการบริหารการศึกษา


